Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms