Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNEQ86WN2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms