Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms