Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC149Q6ZUS6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms