Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00299Q6ZSB3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms