Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBR1LQ6UX01 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBR1LQ6UX01 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms