Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms