Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG9BQ674R7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms