Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms