Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITRM1Q5JRX3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITRM1Q5JRX3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms