Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 OXCT1-204ENST00000509987 1441 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AFMID-202ENST00000409257 1730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 RBMS1P1-201ENST00000417216 1156 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SETP16-201ENST00000531054 711 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 Metazoa_SRP.138-201ENST00000615369 298 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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