Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPAT3Q53EU6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms