Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC38Q502W7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms