Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IMPG1Q17R60 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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