Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CARTPTQ16568 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms