Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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EXT1Q16394 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXT1Q16394 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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