Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NTRK3Q16288 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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