Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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ALX1Q15699 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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ALX1Q15699 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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ALX1Q15699 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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ALX1Q15699 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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ALX1Q15699 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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ALX1Q15699 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ALX1Q15699 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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