Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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RYR3Q15413 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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RYR3Q15413 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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RYR3Q15413 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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RYR3Q15413 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RYR3Q15413 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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