Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCM1Q15154 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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