Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms