Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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