Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNIP1Q15025 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms