Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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