Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFTN1Q14699 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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