Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms