Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAMC2Q13753 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMC2Q13753 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms