Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TUBA3CQ13748 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TUBA3CQ13748 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TUBA3CQ13748 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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TUBA3CQ13748 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TUBA3CQ13748 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA3CQ13748 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TUBA3CQ13748 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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TUBA3CQ13748 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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TUBA3CQ13748 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TUBA3CQ13748 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TUBA3CQ13748 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA3CQ13748 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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