Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROD1Q13562 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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