Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE3BQ13370 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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