Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDRQ13258 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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