Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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NME3Q13232 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NME3Q13232 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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