Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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CALCOCO2Q13137 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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