Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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