Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ACACAQ13085 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ACACAQ13085 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ACACAQ13085 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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ACACAQ13085 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ACACAQ13085 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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ACACAQ13085 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACACAQ13085 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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