Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms