Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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