Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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STX4Q12846 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STX4Q12846 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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