Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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