Protein–RNA interactions for Protein: Q10587

TEF, Thyrotroph embryonic factor, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFQ10587 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TEFQ10587 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TEFQ10587 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TEFQ10587 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TEFQ10587 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TEFQ10587 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TEFQ10587 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TEFQ10587 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TEFQ10587 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TEFQ10587 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TEFQ10587 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TEFQ10587 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TEFQ10587 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TEFQ10587 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TEFQ10587 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TEFQ10587 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms