Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM27E3Q08E93 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms