Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PAX8Q06710 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms