Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN1Q04323 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN1Q04323 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms