Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NHLH2Q02577 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms