Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms