Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDM2Q00987 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms