Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms