Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms