Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms