Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNQ1P51787 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms